在水體底部生態(tài)修復(fù)過程中，生物多樣性的恢復(fù)被認為是水體底部生態(tài)修復(fù)效果的重要指標之一。生態(tài)系統(tǒng)恢復(fù)工作的目標是使退化的環(huán)境恢復(fù)到與原始狀態(tài)相似的狀態(tài)。研究表明，水生植被可以在三個月內(nèi)顯著改善濕地沉積物中的細菌群落結(jié)構(gòu)和特定酶活性。
綜述了沉水植物在改善城市水沙中的研究進展，重點關(guān)注沉水植物在城市水沙修復(fù)過程中的氧化還原特性、污染物去除率和生態(tài)重建等方面的好處。但是，沉水植物在城市水體整治中的應(yīng)用還存在很多問題需要注意：
（1）沉水植物修復(fù)水體的效率和工藝參數(shù)不明確；泥漿修復(fù)對水體和沉積物的理化性質(zhì)和生境改善效果尚不清楚，沉積物和水體的DO和OKP變化、吸收凈化效率值、吸附和微生物協(xié)同凈化等一系列工藝參數(shù)效率和邊界條件仍然是空白。 .
(2) 常用的沉水植物耐環(huán)境沖擊性較弱。沉水植物抗污染負荷、水力沖刷、抗低溫能力較弱，在合流、溢流污染較大的水體中不易生存。在北方地區(qū)，越冬能力較差，如果植物死亡，如果不進行有效搶救，內(nèi)源性污染將進一步增加。
(3)修復(fù)過程緩慢。由于缺乏合適的電子供體或受體，微生物活性有限，植物-微生物協(xié)同修復(fù)過程相對緩慢，周期長，應(yīng)用效果不理想。
（4）植物、微生物或功能材料修復(fù)水體的研究較多，多集中于水質(zhì)改善的研究，而水體與沉積物聯(lián)合修復(fù)的研究較少。植物-微生物功能關(guān)于恢復(fù)水體和沉積物的材料功效的報告甚至更少見。